特殊使命分集剧情介绍（21-40大结局）
第二十一集
巩向光将计就计，让陈静雷的大弟子唐云设法撬开江、卫二人的嘴，两人招认自己是中统派来的，并要求只见陈雨轩。巩向光断定这是CC系派来搞倒自己进而借此搞倒余沁斋的，于是电告余沁斋。余沁斋命他秘密将二人处死。余沁斋则让钉子将巩向光杀死“地下党交通员”的消息散布出去。果然再次引起了地下党对巩向光的怀疑，并中止了与他的联系。虽然秦剑对此持怀疑态度，但巩向光却又一次陷入痛苦之中。
3部电台失而复得，中央决定设立渭情处自己的电台站，并派来两名电报员杨世全和高丽敏。很快，他们与延安建立了电讯联系。地下电台的讯号不久即被军统侦察到。巩向光得知后，急于向秦剑证实情况以便暗中保护。但苦于地下党始终不与他联系，他只好让武平、郑力祥携带藏有联络暗号的蜡丸寻找申北汉。
郑力祥在嫖妓时将蜡丸丢失在小桃房间，对巩向光谎称已经交给了申北汉。小桃则将蜡丸交给了徐夫海。严锟得到蜡丸却却始终猜不透联络信中的含义，于是将其作为巩向光通共的证据保留下来。
巩向光始终见不到地下党，焦急万分，欲利用电台监听获得有关情况。然而他意外截获一则电文：军统要暗杀途径渭城的周恩来。
被免职的余沁斋经多方活动，谋到中统西北专员这一虚职，并来到渭城。
第二十二集
武平设法将暗杀周恩来的情报传送给八联处。八联处指示立即通过报纸舆论揭露并阻止这一阴谋。很快有关消息就被刊登了出来。
余沁斋到渭城后，托名休养，实则寻找时机以图东山再起，另一方面，是要亲自监视和控制巩向光。
余沁斋秘密约见了钉子，钉子正是潜伏在地下党内的记者王济华。王济华建议一举铲除渭城的地下党，而余沁斋的策略却是放水养鱼，并叮嘱王济华，在军统暗杀周恩来一事上，要坐山观虎斗，坐收渔人之利。
边国烈警告严锟不准对周下手，并下令由巩向光和欧阳荷共同负责保卫周恩来在渭城期间的安全。两人一边共同制定相关计划，一边密切注视着严锟的动向。巩向光为此与军统的肖文富私下见面，并迫使其与自己合作。肖文富因利害相关，答应了合作的要求。严锟虽然表现应允了边国烈，但私下在积极准备炸药。
秦剑在自家内借挖防空洞为由，设立起秘密电台。肖文富本来负责利用新式电侦车侦测地下党的电台，但由于心情烦躁，对侦测工作心不在焉，使地下党得以顺利利用电台与延安联系。
余雪瑶得知巩向光天天与欧阳荷在一起，未免有些醋意，
第二十三集
欧阳荷查抄了严锟存放的炸药，严锟却并不在意。各方情报证实，暗杀行动并没停止，但巩向光对暗杀计划几无了解。他如坐针毡，连夜潜入申北汉家，要求地下党随时与他保持联络。
肖文富向巩向光透露严锟还是要用炸药暗杀，这使他和欧阳荷一起想到了汽车，于是立即阻止乘坐边国烈和八联处的汽车。就在他们准备接近汽车时，汽车突然爆炸，巩向光再次保护了欧阳荷，自己却受了伤。
机场上，一假冒记者的刺客欲向周恩来行刺，王济华及时出手阻止。刺客负隅顽抗时，边国烈的副官祁立言将其击毙。这一灭口行为引起欧阳荷怀疑，她和巩向光想以欲擒故纵的方法找到幕后黑手。
祁立言化装后混进宴会厅欲行刺，巩向光赶到后命武平潜入宴会厅抓住祁立言，并将其关押。祁立言逃脱，巩向光等跟踪追击，将祁立言及日特黑田抓获。
余雪瑶因巩向光与欧阳荷整日在一起而不满，余沁斋则警告她警惕巩向光，结果遭到拒绝。
苏杰得到严锟的指示，离开八联处准备逃跑。
第二十四集
得知苏杰逃跑，巩向光、欧阳荷下令关闭城门缉拿，结果苏杰又被严锟灭口。
周恩来安全离渭，从戎代表八路军对之表示感谢。巩向光因忙于保卫事务已疲惫不堪，余雪瑶心疼不已经。
巩向光继续对黑田进行审讯，经过较量，黑田终于落入巩向光的圈套，答应将巩向光与日特合作的建议带给宫本。于是巩向光放了黑田，黑田连忙逃向日本特务所在的据点，巩向光跟踪其后直捣日特巢穴，活捉日特头子宫本，全案至此告破。
巩向光为保卫周恩来立下大功。秦剑约见巩向光，巩向光欣喜异常，买酒准备庆贺。巩向光见到秦剑后，询问延安对自己重新入党的要求是何说法，秦剑最后给了否定的答复，令巩向光失望之极。回到家中，他以酒浇愁，令余雪瑶心中难忍，于是余雪瑶以酒罐为杯，欲将自己灌醉。
巩向光因心病卧床不起。余沁斋借看望来探他的虚实，秦剑则装作医生来对他进行劝导，最终使他得以释怀。
此时又传来一惊人消息，从戎失踪了。
第二十五集
八联处向边国烈提出严重交涉，要求彻查从戎一事。秦剑则通过王琴请巩向光帮助查找从戎，巩向光婉拒；陈雨轩欲让巩向光接手此案，遭到余沁斋的斥责；而严锟暗自得意。
巩向光向边国烈提出陈静雷欲见他，边国烈亲赴精魂武馆，并赠给陈一把珍贵手枪，以示情意。巩向光借机请陈静雷帮助调查从戎失踪一事。
陈静雷弟子不久即获得消息，于是巩向光设计让唐云将徐夫海秘密抓到染房，徐夫海供出了军统直接作案的骆一粟和乔晋，然后又设计将乔晋抓捕，并通知欧阳荷抓捕骆一粟。两人招认事实后，余沁斋称此案不能如实了解，否则会有严重后果，并为巩向光定下指鹿为马的计策。
第二十六集
巩向光依计而行，欧阳荷将此案作为强盗抢劫呈报边国烈。边国烈虽不相信，但又无良策，于是邀请记者参加对骆一粟和乔晋的公开审讯。审讯中，骆、乔二人称自己是土匪，杀害从戎只是见财起意，但八联处张主任当场拿出二人军统证件上的照片，戳穿了这一骗局，从而令边国烈难以收场。最终，边国烈只好舍卒保车，严锟则得以安然过关。
事后余沁斋指责巩向光在照片上做了手脚，却被巩向光反击得无言以对。
皖南事变发生后，潜伏在延安的各路特务活跃起来。延安指示渭情处早日掌握特务潜伏名单，为延安消除隐患。巩向光秘密潜入陈雨轩办公室将名单拍照后送给地下党，却被证实是一份假名单。党组织对他刚刚建立起的一点儿信任又因此而丧失了。
该名单同样被钉子秘送给余沁斋，余沁斋大喜过望。
第二十七集
为获得真名单，巩向光设计，令唐云到赵巧茹家捉奸，并留下奸情证据。文启智无奈，只好与赵巧茹设计将陈雨轩灌醉，盗走陈藏在保险柜中的真名单。
文启智得手后，与冒充军统的曲河约定在一农舍小院交接，不料被徐夫海跟踪而至。王琴得知曲河有危险，也赶赴农舍通知地下党。她正要和曲河撤离时，被徐夫海发现。文启智此时才知道曲河是地下党，于是趁乱枪击曲、王，二人牺牲，文启智得以灭口。
严锟则以通共罪加紧追捕文启智。陈雨轩并不知自己的外室赵巧茹与文启智私通，正打算放文启智逃跑。此时余沁斋出现，陈说了军统抓住文启智后的严重后果。陈雨轩不得不下令抓捕文启智。
巩向光得知王琴牺牲，痛不欲生。余雪瑶则对其进行安慰。
第二十八集
文启智携赵巧茹逃往山村，被陈雨轩的人抓获。
陈雨轩亲自审问赵巧茹，得知她与文启智的奸情后恼羞成怒，将她掐死。然而再审文启智时，文启智死不招供，反而编造一套谎言，令陈雨轩无计可施。陈雨轩想借此案整倒巩向光，诱导徐夫海说出不利于巩向光的情况，并请欧阳荷居间作证。余沁斋料定陈雨轩会借此案做巩向光和他的文章，并想通过巩向光拿到文启智手中的真名单，于是一面让巩向光同意接手此案，一面旁敲侧击地迫使陈雨轩将此案移交给巩向光。
巩向光在审讯中机智地与文启智周旋，使文启智交待出名单的藏匿处。
巩向光得到名单后，一面派武平暗中将其交给地下党，一面制造假象迷惑陈雨轩。陈雨轩派朱然跟踪巩向光，巩向光则将计就计把朱然引到名为药店实为军统秘密联络点之处。朱然查抄该药店，引得严锟大怒，军统中统双方在药店大闹起来，无果而终，反而使严锟的联络点暴露无遗。
事情闹到边国烈处，边国烈对双方各打五十大板后，找来巩向光询问疑点，被巩向光巧妙遮掩过去。
第二十九集
巩向光提供的真名单，使延安清除了隐患，也使秦剑、张主任逐渐产生了信任，二人打算帮助巩向光去延安澄清过去的问题。秦剑建议让巩向光以公开身份前往延安，张主任表示支持，但需要向延安请示。
此后，巩向光又将真名单提供给余沁斋，以获取其信任。此前，地下党在传送名单的过程中，钉子已经将名单复制并提供给余沁斋。余沁斋将两发名单核对后，发现完全一样，不免大惑不解。
鉴于陈雨轩与巩向光之间的矛盾，边国烈将文启智案交给欧阳荷审理。欧阳荷审后将结论定为陈雨轩公报私仇。此时，边国烈又得到情报，称延安的中统潜伏人员全线破灭。于是边国烈将陈雨轩拘捕送交重庆。
钉子王济华此时已被地下党识破，巩向光在地下党的配合下，消除了钉子。
余沁斋被任命为中统渭城主任，开始捣毁地下党的联络点，但一无所获。
余雪瑶受人之托，请巩向光为教育局孙局长雪“冤”。巩向光了解情况后，一一指说其劣行，使余雪瑶对社会黑暗有了一些了解。
秦剑将上级同意去延安的消息告诉巩向光，巩向光以去延安重建情报网为由说服余沁斋同意此行。
第三十集
巩向光的延安之行刚有眉目，张主任突然通知取消行程，这又在出乎巩向光意外，他感到命运对他的捉弄有些太残酷了。但余沁斋、边国烈也已同意延安之行，他找不出不去的理由，只得让武平在街头袭击自己，用伤势作为借口。巩向光的被袭引起了多方猜疑，巩向光顺水推舟，将众人的视线引向严锟。
严锟则开始对郑力祥实施招纳计划，准备在必要时让郑力祥除掉巩向光。郑力祥的反常行为引起了余雪瑶的怀疑和批评，为此郑力祥和武平两人吵了起来，兄弟矛盾由此而生。此时，余雪瑶有了身孕。
巩向光得知地下党的电台密码即将被破译，于是通知秦剑停止使用电台。延安为此将派遣特派员来渭城。这一消息也被重庆获得，中统总部也派专人将情报送给余沁斋。余沁斋指示朱然负责抓捕延安特派员洪定坤。
洪定坤按约定到茶楼与秦剑接头。
第三十一集
特务将茶楼包围，秦剑为掩护洪定坤脱身而被捕。
军统副站长冯贤章在妓院面见郑力祥，迫使郑力祥作为线人监视巩向光在家中的举动。郑力祥从妓院出来时，恰被武平发现。兄弟二人为此争吵以至动起手来。郑力祥佯作改悔。
巩向光伤愈得知秦剑被捕，地下党找到巩向光让其设法营救秦剑，而余沁斋则让巩向光接手秦剑的案子，欲借此试探巩向光。边国烈则派欧阳荷协助巩向光，意欲一探巩向光的真伪。巩向光面临严峻考验。
余雪瑶因妊娠反应强烈，住进医院。巩向光在从医院回家途中，偶然发现郑力祥出入妓院，本来心情极坏的巩向光怒不可遏，打了郑力祥一耳光。郑力祥则认为是武平告了他的状，从此兄弟二人反目。
第三十二集
为营救秦剑，巩向光定下计策并要求地下党配合。
某日晚，巩向光又在节余上喝得大醉。欧阳荷与康莉将其送回家，在返回时被地下党劫持出城。第二天，康莉被放回，她跑到余沁斋处求救，说地下党要求用秦剑来交换欧阳荷。欧阳荷的特殊身份使余沁斋不得不答应对方的条件。
严锟此时觉得巩向光过于危险，不能不除，于是让肖文富逼迫郑力祥毒死巩向光。郑力祥犹豫再三，最终同意了。
巩向光为确保营救行动成功，请陈静雷帮忙。陈静雷得知要营救的正是击毙六指神、为自己报杀母之仇的恩人时，立即同意派人助战。
康莉在为地下党与中统之间传递交换人质消息的同时，被军统跟踪。严锟立即推断出其中奥秘，决定派人秘密前往交换人质的地点。
郑力祥在家中借送茶之机，欲毒死巩向光，不料事有意外，未能成功。
交换人质的行动开始前，余沁斋突然称有事不参与行动了。于是巩向光押解秦剑赶赴交换地点。严锟也带人隐藏在交换地的树丛中。
交换开始后，军统突然出现，巩向光、陈静雷的人与军统交战。秦剑与地下党趁机脱身。秦剑为掩护洪定坤孤身一人撤到河边，被隐在树丛中的余沁斋击伤，巩向光舍身去救，途中被郑力祥从身后开枪击伤。欧阳荷见状将郑力祥击毙。
巩向光要与秦剑一起过河去延安，两人在河水中争执起来。
第三十三集
为了保护巩向光，秦剑大骂巩向光叛徒并开枪自尽。巩向光终于没有跑向河对岸。
由于秦剑牺牲，洪定坤决定暂时停止渭情处的活动。
巩向光对郑力祥之死怀有疑虑，认为欧阳荷在搞鬼。而秦剑的牺牲，再次引起一些地下党员对巩向光的怀疑与误解，洪定坤决定停止与巩向光的联系。另一方面，余沁斋也巩向光在河中的行为有所怀疑。而巩向光只能对武平说明秦剑牺牲的实情。
余雪瑶得知巩向光受伤，不顾身孕要去探望。余沁斋未能拦住，她一下滾下楼梯，以致流产。
严锟将巩向光的通共材料上报重庆，蒋介石亲自批复逮捕巩向光。
边国烈接到逮捕巩向光的命令，让欧阳荷到巩向光家进行试探。欧阳荷将实情相告，并提醒他天黑时才会行动。然而巩向光未理会她的暗示，安排了一下后事之后，自己毅然走向司令部。这令边国烈摸不清他到底是不是共产党。
武平遵嘱将一箱物品交给陈静雷，陈静雷猜测到巩向光遇到危难，叮嘱武平自己会鼎力相助。
第三十四集
巩向光被押往重庆，余雪瑶得知消息后请求余沁斋搭救，并找到边国烈要求搭机去重庆。边国烈告诉她，欧阳荷已经去搭救巩向光了，余雪瑶大感意外。
严锟命肖文富查抄巩向光家，肖文富在巩向光家遇到了陈静雷，结果查抄未成，反碰了一鼻子灰。
余沁斋来到重庆搭救巩向光，但徒劳无果。余雪瑶也来到重庆，也是一筹莫展。
巩向光在重庆狱中并未失志，坚持锻炼。保密局对他的审讯也毫无收获。
一天，巩向光被人从牢房中唤出，巩向光自感大限已到，欲坦然就义。然而狱门大开，余雪瑶、余沁斋竟在门外迎接他。原来是欧阳荷利用与美国军事顾问的关系使得巩向光绝处逢生。
巩向光再度回到渭城，然而他已经离开中统，边国烈把他安排到司令部做了上校参谋，并在情报处工作。余雪瑶对巩向光去情报处颇有疑虑，巩向光以为她又在吃欧阳荷的醋，她告诉了巩向光她对欧阳荷的怀疑。
边国烈召开重要军事会议，商定进攻囊形地区的作战计划。
第三十五集
巩向光打算将边国烈的进攻意图通知地下党，但始终未能与对方联系上。
巩向光得知边国烈的作战部将用临时密码将作战计划发往国防部，找到文启智了解编制临时密码的奥秘，并通过监听破译了作战计划。之后，巩向光把电台交还了余沁斋。余沁斋感到其中肯定有问题，但一时又搞不清楚。
由于巩向光无法与地下党取得联络，于是用地下党早已废弃的旧密码，将作战计划直接发往延安。延安此前已收到其它途径获得的同一作战计划，两相对照完全一样。从而使边国烈对囊形地区的进攻彻底失败。
事后，边国烈令严锟对泄密一事进行调查，严锟把怀疑的视线转向欧阳荷，但又苦无证据。此事只得不了了之。
经05号建议，地下党终于恢复了与巩向光的联系，并决定让秦剑的妻子刘菊芳以佣人身份进入巩向光家，作为地下联络员。
边国烈上次进攻失败后，受命直接进攻延安。地下党请巩向光尽快获得进攻延安的计划，巩向光则请地下党协助拿到边国烈机要室保险柜的钥匙。
第三十六集
07号柴云生用财色引诱机要室的刘参谋，并设计从刘参谋处复制了保险柜钥匙，地下党通过刘菊芳将钥匙交到巩向光手中。
按地下党的计划，一方面柴云生将刘参谋调虎离山，一方面巩向光进入机要室获取进攻延安的计划。但余沁斋的突然到来，使巩向光无法脱身。在陈静雷的的协助下，巩向光终于拿到了计划并交给地下党。
巩向光的举动似乎证实了余雪瑶的怀疑，余雪瑶当面说出巩向光的真实身份，并劝巩向光回头。在巩向光的劝说下，余雪瑶开始站在了他的一边。
边国烈召集巩向光重要会议，结果却是携他及一批军事要员秘密前往前线，准备开始进攻延安的军事行动，并确定了进攻时间。巩向光借旧病复发向家中索要药物，将写有情报的密信托人带给刘菊芳。
第三七集
余沁斋对刘菊芳已有所怀疑，于是派特务盯着她。地下党发现刘菊芳处在危险之中，多次让她离开巩向光家。但她担心无人传递情报还是留了下来。
余沁斋来到了巩向光家，向余雪瑶了解刘菊芳的情况，余雪瑶为她遮遮掩掩。
边国烈进入率军进入延安后，得到却是一座空城。为找到延安的中央机关，军统调来了新式侦测设备，恰被巩向光遇到。巩向光再次向刘菊芳传回情报。
余沁斋的到来，使余雪瑶感到刘菊芳已身处险境，于是委婉地劝她马上离开自己家。刘菊芳为传送情报，答应明天就走，结果失踪了。
余雪瑶找到余沁斋询问刘菊芳的下落，才得知她被捕后自尽身亡。
第三十八集
边国烈进攻延安又以失败告终，巩向光随边国烈回到渭城。
巩向光回家后，得知刘菊芳牺牲的消息十分悲痛，余雪瑶也为刘菊芳的死而懊悔不已。巩向光向余雪瑶讲了他在前线看到的一切，使余雪瑶彻底丧失了对国民党的信心，但面对着大哥的丈夫，她又处于难以选择的巨大痛苦之中。
巩向光接到地下党通知，以为对方因刘菊芳一事而处决自己。当他见到洪定坤后，洪定坤向他宣布了延安的决定，恢复他的党籍。他热泪盈眶。地下党同时交给他获取敌人潜伏保单的任务。
文启智虽然被提升为副主任，但他见局势每况日下，准备为自己找条后路。巩向光答应帮助他，但要求他交出潜伏名单，文启智最终答应三根金条交换。
余沁斋找到余雪瑶，也希望她在自己和巩向光之间做出选择。然而余雪瑶还是选择了巩向光。余沁斋为此既无奈又痛心。
巩向光正为为筹集金条而苦恼，余雪瑶得知后将自己的嫁妆拿出。
第三十九集
巩向光和余雪瑶正在准备金条时，恰被前来的余沁斋发现。余雪瑶为巩向光作伪证，被余沁斋识破，巩向光则巧妙地搪塞过去。
肖文富的妻子催促肖文富赶快逃离渭城，巩向光前来说服肖文富交出破坏计划和潜伏名单，被肖文富拒绝。
巩向光得到文启智的名单后，正要离家去送给地下党。余沁斋恰好赶来，要见巩向光。余雪瑶一面暗中帮助巩向光悄悄离开，一面阻止余沁斋。然而女佣王妈无意间透露了巩向光的去向。
巩向光在古塔公园将中统潜伏名单交给洪定坤。突然发现情况不对，于是让洪定坤迅速脱身。这时余雪瑶赶到，告诉他特务已经来了，话音刚落，余沁斋指挥特务开了枪，余雪瑶被误击身亡。巩向光悲怒万分。
肖文富最终同意交出计划和名单，并要求与地下党见面。洪定坤与之相见，给了他所要的十根金条。但肖文富只交出计划未交名单，称下次再交。
第四十集
解放军兵临城下，边国烈正准备逃跑，但他让巩向光留下，并将巩母作为人质随军带走。地下党得知后，让申北汉去营救。
严锟任命肖文富为站长，称自己先期离开渭城。严锟发现肖文富在做着秘密勾当，于是欲枪毙肖文富。肖妻见状，将严锟击毙。
肖文富湖边与巩向光见面并交给他名单，朱然跟踪而至将肖文富击毙，正要开枪击毙巩向光时，欧阳荷突然出现，将朱然打死。
边国烈等重要军事官员逃离渭城，欧阳荷也随之而去
余沁斋见大势已去，回到家中用毒酒自杀。
渭城解放。张主任亲手把一套解放军军装递给巩向光，欢迎他的归队。
在陵园中，巩向光向余雪瑶的墓献上了一束鲜花。
在军区会客室中，巩向光再一次见到了身穿解放军制服的欧阳荷，此时他才知道，她就是05号。
